കൊളംബിയൻ ടീമിന്റെ പരിശീലക സ്ഥാനത്ത് നിന്ന് പെക്കർമാൻ പടിയിറങ്ങി. 6 വർഷത്തിൽ അധികം കൊളംബിയയെ പരിശീലിപ്പിച്ചതിനു ശേഷമാണു പെക്കർമാൻ പടിയിറങ്ങുന്നത്. രണ്ടു ലോകകപ്പിൽ അടക്കം കൊളംബിയയെ പരിശീലിപ്പിച്ച പെക്കർമാൻ കൊളംബിയയെ രണ്ടു തവണയും ടീമിന്റെ നോക് ഔട്ട് ഘട്ടത്തിൽ എത്തിച്ചിരുന്നു.
2012 ജനുവരിയിലാണ് പെക്കർമാൻ കൊളംബിയയുടെ പരിശീലകനായി ചുമതലയേറ്റത്. കൊളംബിയ ടീമിന്റെ മോശം അവസ്ഥയിലാണ് പെക്കർമാൻ പരിശീലകനായി ചുമതലയേൽക്കുന്നത്. തുടർന്ന് അങ്ങോട്ട് കൊളംബിയ ടീമിനെ ലാറ്റിൻ അമേരിക്കയിലെ മികച്ച ഫുട്ബോൾ ടീമായി വളർത്തിക്കൊണ്ടുവരാൻ ഈ അർജന്റീനക്കാരനായി.
റഷ്യൻ ലോകകപ്പിൽ പെനാൽറ്റിയിൽ ഇംഗ്ലണ്ടിന് തോറ്റു കൊളംബിയ ലോകകപ്പിൽ നിന്ന് പുറത്തായിരുന്നു. ഇതിനെ തുടർന്നാണ് പെക്കർമാൻ കൊളംബിയയുമായുള്ള കരാർ പുതുക്കുന്നില്ലെന്ന് തീരുമാനിച്ചത്. 2014ലോകക്കപ്പിൽ ക്വാർട്ടർ ഫൈനലിൽ ബ്രസീൽ ആണ് പെക്കർമാന്റെ കൊളംബിയയെ തോൽപ്പിച്ചത്. 2022 ഖത്തർ ലോകകപ്പ് വരെ പെക്കർമാൻ കൊളംബിയയുടെ പരിശീലകനായി തുടരണമെന്ന് കൊളംബിയ ഫുട്ബോൾ ഫെഡറേഷൻ ആഗ്രഹിച്ചിരുന്നെങ്കിലും പെക്കർമാൻ കരാർ പുതുക്കേണ്ടതില്ലെന്ന് തീരുമാനിക്കുകയായിരുന്നു.
